Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef1Q99JL1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spef1Q99JL1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms