Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Afg3l1Q920A7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms