Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trub2Q91WG3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms