Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgbl1Q8VDV0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgbl1Q8VDV0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgbl1Q8VDV0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms