Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CopaQ8CIE6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms