Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl1Q8CEQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl1Q8CEQ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms