Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup88Q8CEC0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup88Q8CEC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms