Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo43Q8CDI2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo43Q8CDI2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo43Q8CDI2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fbxo43Q8CDI2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms