Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4aQ8C9S8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4aQ8C9S8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4aQ8C9S8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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