Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4L8

C130073F10Rik, RIKEN cDNA C130073F10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C130073F10RikQ8C4L8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C130073F10RikQ8C4L8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C130073F10RikQ8C4L8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms