Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser1Q8C0C4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccser1Q8C0C4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser1Q8C0C4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms