Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TtpaQ8BWP5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms