Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup54Q8BTS4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup54Q8BTS4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup54Q8BTS4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup54Q8BTS4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup54Q8BTS4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup54Q8BTS4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup54Q8BTS4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup54Q8BTS4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup54Q8BTS4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms