Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fbxo38Q8BMI0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo38Q8BMI0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms