Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube2q1Q7TSS2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms