Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppp1r3cQ7TMB3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppp1r3cQ7TMB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ppp1r3cQ7TMB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppp1r3cQ7TMB3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ppp1r3cQ7TMB3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms