Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Syne2Q6ZWQ0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms