Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp34Q6ZQ93 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp34Q6ZQ93 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp34Q6ZQ93 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms