Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms