Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bms1Q6PGF5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bms1Q6PGF5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms