Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim37Q6PCX9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim37Q6PCX9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim37Q6PCX9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms