Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gapvd1Q6PAR5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gapvd1Q6PAR5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gapvd1Q6PAR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Gapvd1Q6PAR5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms