Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp49Q6P9L4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp49Q6P9L4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms