Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms