Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf8Q6DID3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf8Q6DID3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms