Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Msl2Q69ZF8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Msl2Q69ZF8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msl2Q69ZF8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms