Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sptbn2Q68FG2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn2Q68FG2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms