Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp4Q62445 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sp4Q62445 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms