Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf6Q62311 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms