Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sin3bQ62141 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sin3bQ62141 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms