Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Npm1Q61937 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Npm1Q61937 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Npm1Q61937 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Npm1Q61937 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms