Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gli3Q61602 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gli3Q61602 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli3Q61602 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli3Q61602 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gli3Q61602 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms