Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NinQ61043 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinQ61043 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinQ61043 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinQ61043 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NinQ61043 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NinQ61043 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NinQ61043 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinQ61043 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinQ61043 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinQ61043 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinQ61043 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NinQ61043 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NinQ61043 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinQ61043 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinQ61043 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinQ61043 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinQ61043 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NinQ61043 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NinQ61043 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NinQ61043 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NinQ61043 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NinQ61043 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinQ61043 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinQ61043 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NinQ61043 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NinQ61043 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinQ61043 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinQ61043 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinQ61043 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinQ61043 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinQ61043 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NinQ61043 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinQ61043 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NinQ61043 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NinQ61043 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinQ61043 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NinQ61043 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NinQ61043 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinQ61043 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinQ61043 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinQ61043 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinQ61043 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinQ61043 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NinQ61043 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinQ61043 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NinQ61043 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NinQ61043 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NinQ61043 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms