Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atf3Q60765 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Atf3Q60765 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf3Q60765 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms