Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csnk2a1Q60737 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csnk2a1Q60737 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms