Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sin3aQ60520 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sin3aQ60520 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sin3aQ60520 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.8 ms