Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf15Q5UBV8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf15Q5UBV8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms