Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NacadQ5SWP3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NacadQ5SWP3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NacadQ5SWP3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
NacadQ5SWP3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NacadQ5SWP3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC38■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NacadQ5SWP3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NacadQ5SWP3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms