Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVL9

Prl2c1, Growth hormone d22, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl2c1Q5SVL9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prl2c1Q5SVL9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl2c1Q5SVL9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl2c1Q5SVL9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms