Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfasQ5SUR0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfasQ5SUR0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfasQ5SUR0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfasQ5SUR0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PfasQ5SUR0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfasQ5SUR0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PfasQ5SUR0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms