Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm6bQ5NCY0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kdm6bQ5NCY0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kdm6bQ5NCY0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm6bQ5NCY0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm6bQ5NCY0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms