Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm3Q5F4S9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpm3Q5F4S9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm3Q5F4S9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms