Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nlrc3Q5DU56 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nlrc3Q5DU56 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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