Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx49Q4FZF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx49Q4FZF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.2 ms