Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1nQ497L1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H2al1nQ497L1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al1nQ497L1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1nQ497L1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1nQ497L1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1nQ497L1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al1nQ497L1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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