Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx25Q3ZT31 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx25Q3ZT31 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx25Q3ZT31 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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