Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms