Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrfip1Q3UZ39 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrfip1Q3UZ39 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms