Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn13Q3UW68 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms