Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPI1

Fam198b, Protein FAM198B, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam198bQ3UPI1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam198bQ3UPI1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam198bQ3UPI1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam198bQ3UPI1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms